Untuk mencegah penyebaran pandemi virus Corona/ COVID-19 yang saat ini sedang melanda berbagai negara di dunia, di Museum Sonobudoyo dilakukan penyemprotan disinfektan dari BPBD DIY serta didampingi oleh jajaran polisi dari Polsek Gondomanan. Penyemprotan dilakaukan dalam dua tahap. Tahap pertama dengan menggunakan mobil penyemprot dilakukan penyemprotan di wilayah luar museum. Kemudian tahap kedua dengan alat penyemprot disinfektan yang bisa menjangkau seluruh area bagian dalam museum. Mekanisme ini merupakan salah satu upaya yang dilakukan oleh Museum Sonobudoyo dalam rangka memerangi penyebaran COVID-19.